學理的探索、真理的追尋(3)-番外篇:有關酶分類的討論(更正)
學理的探索、真理的追尋(3)-番外篇:有關酶分類的討論(更正) https://www.facebook.com/share/p/1CjXysRD4y/ 有留言提出一個很有趣又重要的議題: 國際酵素分類編碼七大類中,Rubisco 是被歸在第四大類,也就是lyase(裂解酶)類, 而不是第一大類,oxidoreductase(氧化還原酶類):因此如果這題在考試中出現,詢問Rubisco分類的話,依照蔡老師您的解釋,學生選擇氧化還原酶,答案就錯了,因此在教學上可能還是要進一步說明分類的主因,會比較完整。 附上分類連結:https://www.enzyme-database.org/query.php?ec=4.1.1.39 因為這個議題具有很高的學理討論價值,我覺得應該好好討論,而不只是回覆留言,所以本文就誕生了.... 我的回覆如下: 酵素委員會編號(EC編號)依據酵素催化過程,受質與產物的變化方式,將酶分為七類: (一)、EC 1 氧化還原酶(Oxidoreductases):催化「氧化還原反應」 (二)、EC 2 轉移酶(Transferases):催化「將一個官能基從受質轉移到另一受質」 (三)、EC 3 水解酶(Hydrolases):催化「受質經過水解產生兩種產物」 (四)、EC 4 裂解酶(Lyases):催化「不經過水的作用,使C-C、C-N、C-O 或 C-S 鍵斷裂」 (五)、EC 5 異構酶(Isomerases):催化「分子內結構重組」 (六)、EC 6 連接酶(Ligases):催化「經由ATP的水解,使兩分子間形成C-O, C-S, C-N or C-C鍵結而連接」 (七)、EC 7 轉位酶(Translocases):催化「離子或分子的跨模運輸」,是在 2018年8月新增的分類 若同一酵素有多種催化機制,是以該酵素"最主要的功能"作為分類依據。 1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase, RuBisCO)最主要的功能是參與光合作用的固碳反應,也就是將CO2與二磷酸核酮糖(RuBP)經催化而形成兩個磷酸甘油酸(PGA),過程中有C-C鍵斷裂,也不須水的參與(不屬於水解),故屬於EC 4 裂解酶(Lyases)。 但RuBisCO也可...